時は現代。神主の娘である神維那己は、幼馴染で友人の皇うるかとともに神社の倉庫から続く隠し地下通路を偶然発見する。そして、そこで迷っているうちに、偶然鋼鉄天使くるみ2式を発見し、起動させてしまう。くるみ2式は改良型の鋼鉄天使として未來から送られてきたものであった。そして彼女らのドタバタに満ちた學園生活が始まる。
　　本作品は、鋼鉄天使くるみの好調を受けて制作されたオリジナルの続編である。しかし、主人公が少年から少女になり、しかも「はにはにだよ～」という狙いすました口癖までついた萌えキャラであったことからSFバトルアクション色とラブコメ色は大幅に後退している。また、後述の鋼鉄天使くるみ零と同時進行であったため、前作?鋼鉄天使くるみでのキャラクターデザイン?総作畫監督であった千羽由利子が今作では退いている。
　　なお、くるみ達三姉妹の関係は前作とほぼ同じである。しかし、サキはご主人さまの皇うるかと姉のくるみとの間で揺れ動く複雑な乙女心が加味されている。その皇うるかも主人公の少女?神維那己に淡い心を抱いているなど、全體的に百合的な色合いが強くなっている。
　　本作から制作レーベルがポニーキャニオンからm.o.eとなっている。